文朝慧, 何蘇琴, 荊卓瓊
(1.甘肅省出入境檢驗(yàn)檢疫局,蘭州 730020;2.甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,蘭州 730070)
甘肅省馬鈴薯壞疽病病原鑒定
文朝慧1, 何蘇琴2*, 荊卓瓊2
(1.甘肅省出入境檢驗(yàn)檢疫局,蘭州 730020;2.甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,蘭州 730070)
本文通過Koch’s法則以及形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)方法對(duì)甘肅省蘭州市馬鈴薯壞疽病進(jìn)行病原鑒定。從馬鈴薯壞疽病標(biāo)樣中分離得到5株形態(tài)特征一致的產(chǎn)生分生孢子器的腔孢綱真菌,其代表菌株GSAA-0232對(duì)馬鈴薯塊莖具有強(qiáng)的致病性,用該菌接種馬鈴薯塊莖,可引起與自然發(fā)病相同的壞疽病癥狀。該菌的培養(yǎng)物生成代謝物“E”(NaOH斑反應(yīng)顯示出特有的紫紅色)。利用引物Phoma-2/Phoma-7可擴(kuò)增出474bp的Phomafoveata特異條帶。根據(jù)其形態(tài)特征、生物學(xué)特性、致病性及分子生物學(xué)鑒定結(jié)果 (GenBank登錄號(hào):JQ963624),將菌株GSAA-0232鑒定為Boeremiafoveata(Foister)Aveskamp,Gruyter &Verkley。這是Boeremiafoveata引起馬鈴薯壞疽病在我國的首次報(bào)道。
馬鈴薯; 壞疽??;Boeremiafoveata;Phomafoveata
隨著產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu)的調(diào)整,馬鈴薯已成為甘肅省重要的經(jīng)濟(jì)作物,種植面積和總產(chǎn)量在國內(nèi)都名列前
茅[1],2011年全省馬鈴薯播種面積達(dá)700 000hm2[2]。隨著馬鈴薯集約化程度的提高,馬鈴薯貯藏期腐爛問題也日漸突出[3-4]。
2002、2009年,作者在蘭州市榆中、皋蘭出產(chǎn)的馬鈴薯薯塊中發(fā)現(xiàn)了壞疽病病薯,并對(duì)病原菌進(jìn)行了分離和鑒定,現(xiàn)將研究結(jié)果報(bào)告如下。
PDA:馬鈴薯200g,葡萄糖15g,瓊脂粉12g,自來水1 000mL。
OA:燕麥片20g,瓊脂粉12g,自來水1 000mL。
MEA:麥芽浸粉40g,瓊脂粉12g,自來水1 000mL。
根據(jù)自然感病和人工接種發(fā)病薯塊進(jìn)行癥狀描述。
病薯標(biāo)樣采集自蘭州榆中和皋蘭菜農(nóng)自產(chǎn)自銷的商品薯,取病健交界處病組織做常規(guī)分離,挑取尖端菌絲進(jìn)行純化。
用直徑0.5cm打孔器在經(jīng)75%乙醇表面消毒的健康馬鈴薯薯塊上打一深0.5cm小孔,將在PDA平板上20℃培養(yǎng)4d的直徑0.5cm病菌菌絲塊接種于孔中,再將原薯塊組織塞回并用透明膠帶封口,置5℃和15℃培養(yǎng),不接菌為對(duì)照,每處理5個(gè)馬鈴薯薯塊。16d后切薯調(diào)查發(fā)病情況并對(duì)發(fā)病薯塊進(jìn)行病原菌再分離。
切取直徑5mm的菌絲圓片移植于PDA平板中央,分別于5、10、15、20、25、30、35℃下恒溫培養(yǎng),6d后測量菌落直徑,觀察記載病菌培養(yǎng)性狀及形態(tài)特征。每處理重復(fù)3次;繼續(xù)培養(yǎng)至20~40d,觀察測量分生孢子器及器孢子的形態(tài)和大小。
取直徑5mm的菌絲圓片移植于OA、MEA平板中央,20℃黑暗培養(yǎng)7d,測量菌落直徑,描述菌落形態(tài);然后將培養(yǎng)皿轉(zhuǎn)放到13h近紫外燈+11h黑暗/d,20℃培養(yǎng),以刺激菌落色素的產(chǎn)生和分生孢子器的生成,7d后再次描述菌落形態(tài),并在菌落邊緣滴加1mol/L NaOH 水溶液,觀察色斑反應(yīng)[5-6]。
將待鑒分離物置PDA培養(yǎng)基、20℃、黑暗條件下培養(yǎng)5d,刮取菌落邊緣新鮮菌絲,采用常規(guī)CTAB法提取基因組DNA為擴(kuò)增模板,利用特異引物Phoma-2:5′-GGACCCCTGTACTGACGTC-3′和 Phoma-7:5′-AGC GGCTAGGATAGACAGGCG-3′,擴(kuò)增病菌基因組DNA中的特異片段[7]。PCR反應(yīng)體系總體25μL:10×Taqreaction buffer 2.5μL,1.5mmol/L MgCl22μL,dNTPs(2.5mmol/L)1μL,引物(20μmol/L)各0.5μL,Taq(5U/μL)0.2μL,DNA模板1μL,ddH2O補(bǔ)足25μL體積。反應(yīng)程序?yàn)?4℃預(yù)變性3min;94℃15s,62℃30s,72℃1min,30個(gè)循環(huán);72℃延伸10min,4℃保存。1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物。預(yù)期產(chǎn)物經(jīng)回收、連接轉(zhuǎn)化和PCR鑒定后,純化質(zhì)粒送大連寶生物工程有限公司測序。測序結(jié)果與NCBI/GenBank數(shù)據(jù)庫中的已有序列進(jìn)行BLASTn比對(duì),確定與試驗(yàn)菌株的相關(guān)性。
分別用限制性內(nèi)切酶DdeⅠ和DpnⅡ酶切PCR反應(yīng)產(chǎn)物,10μL體系:5μL PCR反應(yīng)液,0.5μL限制性內(nèi)切酶溶液,1μL緩沖液,ddH2O補(bǔ)足體積,37℃酶切3h。產(chǎn)物用2.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測,鑒別PCR反應(yīng)產(chǎn)物的DdeⅠ和DpnⅡ的酶切圖譜。
病薯外表可見不規(guī)則黑褐色稍凹陷斑塊,切開病薯,薯內(nèi)形成大的孔洞,腐爛組織呈淡褐色、深紅褐色或深褐色,自然發(fā)病的病薯一般自臍點(diǎn)或有傷痕處形成侵染(圖1a~c)。
從典型壞疽病癥狀的馬鈴薯病薯上分離得到5株菌落形態(tài)一致的褐色、產(chǎn)生分生孢子器的腔孢綱真菌,將其中的代表菌株編號(hào)GSAA-0232。
不同溫度條件下病害癥狀及嚴(yán)重度不同:15℃下,病斑深紅褐色,在薯內(nèi)形成大的裂孔,表皮黑褐色,不規(guī)則,稍下陷,病斑長16~31mm(平均21.3mm),寬14~25mm(平均18.0mm),深22~29mm(平均25.3mm);5℃下,病斑淡紅褐色至淡褐色,病組織糟松狀,有時(shí)有小的開裂,表皮黑褐色,不規(guī)則,稍下陷,病斑長15~19mm(平均17.0mm),寬13~16mm(平均14.7mm),深10~14mm(平均12.0mm)。15℃下薯塊受害較5℃下嚴(yán)重。對(duì)照未發(fā)病。
15℃回接發(fā)病的馬鈴薯塊莖表現(xiàn)出與自然病薯相同的癥狀。從回接發(fā)病馬鈴薯塊莖中可100%分離得到原接種病菌。
GSAA-0232在PDA平板上,20℃培養(yǎng)7d,菌落直徑(69.7±0.5)mm,菌落灰褐色,邊緣白色,菌落背面黃褐色;培養(yǎng)20d,菌落紅褐色,表層的網(wǎng)狀菌絲上散生大量黑色微粒狀分生孢子器,菌落表面散布無色透明微小水珠,菌落背面可見大小不等的黑褐色斑塊。
GSAA-0232在OA平板上,20℃培養(yǎng)7d,菌落直徑(72.2±0.6)mm,菌落黃褐色,邊緣整齊,幾乎沒有氣生菌絲,菌落背面黃褐色;培養(yǎng)14d,菌落深豆沙色,氣生菌絲薄而稀疏,邊緣稍多;培養(yǎng)基內(nèi)生大量深褐色斑塊,菌落背面與正面色同。
GSAA-0232在MEA平板上,20℃培養(yǎng)7d,菌落直徑(70.7±1.2)mm,菌落淡黃褐色,邊緣整齊,氣生菌絲薄氈狀,菌落背面亮黃褐色;培養(yǎng)14d,菌落黃褐色,氣生菌絲薄氈狀,菌落表面散生暗褐色分生孢子器,菌落背面亮黃褐色,可見黃色粉粒狀結(jié)晶。
NaOH斑反應(yīng)顯示出特有的紫紅色,顯示菌株GSAA-0232生成代謝物“E”(即可擴(kuò)散的蒽醌色素,在酸性條件下蒽醌色素呈黃色,在堿性條件下呈紅色)[5-6]。
GSAA-0232菌落形態(tài)及 NaOH斑反應(yīng)見圖1d~g。
菌絲的適宜生長溫度為15~20℃;30℃和35℃下菌絲不生長,在30℃和35℃下培養(yǎng)5d后,將培養(yǎng)皿移至20℃,30℃下培養(yǎng)5d的接種體可恢復(fù)生長,35℃下培養(yǎng)5d的僅有1/3的接種體可恢復(fù)生長(圖2)。
圖1 馬鈴薯壞疽病癥狀、菌落形態(tài)及NaOH色斑反應(yīng)
圖2 溫度對(duì)GSAA-0232菌絲生長的影響(PDA平板,培養(yǎng)6d)
GSAA-0232的顯微形態(tài)特征:PDA平板20℃培養(yǎng),菌絲無色至褐色,粗菌絲10.0~12.5μm;中等粗菌絲3.7~8.7μm;細(xì)菌絲1.3~2.5μm;分生孢子器壇形,散生或聚生于培養(yǎng)基表面及培養(yǎng)基內(nèi),深褐色,常被褐色網(wǎng)狀菌絲包圍,孔口不明顯,直徑89.1~198.0μm,平均139.8μm;高108.9~297.0μm,平均162.5μm;器孢子單孢,無色,壁薄,兩端鈍圓的短柱狀、長橢圓形、香蕉形,甚至不規(guī)則形,孢子均勻或一端稍大,直或略彎,(3.0~7.5)μm×(2.0~3.0)μm,平均(5.3×2.4)μm。在 MEA 平板20℃培 養(yǎng),器 孢 子 大 小 為 (4.0~7.5)μm× (1.2~2.5)μm,平均(5.4×1.8)μm(圖3)。
圖3 GSAA-0232顯微形態(tài)特征
引物Phoma-2/Phoma-7在菌株 GSAA-0232中擴(kuò)增出約474bp的Phomafoveata特異條帶[7]。
測序后經(jīng)BLAST比對(duì)表明,該序列(JQ963624)與Phomafoveata菌株79/139(AF079897.1)、ATCC 24771(AF079896.1)序列同源性為100%。
擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)DdeⅠ酶切后產(chǎn)生256bp和118bp 2個(gè)條帶,經(jīng)DpnⅡ酶切后產(chǎn)生267bp和207bp 2個(gè)條帶,與預(yù)期片段大小相符(圖4)。
圖4 PCR檢測及酶切圖譜
從蘭州馬鈴薯壞疽病病薯中分離得到菌落形態(tài)一致的產(chǎn)分生孢子器的腔孢綱真菌,其代表菌株GSAA-0232對(duì)馬鈴薯塊莖具有強(qiáng)的致病性,培養(yǎng)物生成代謝物E(NaOH斑反應(yīng)顯示出特有的紫紅色),利用引物 Phoma-2/Phoma-7可擴(kuò)增出474bp的Boeremiafoveata(=Phomafoveata)特異條帶。根據(jù)其形態(tài)特征、生物學(xué)特性、致病性及分子檢測結(jié)果,將菌株GSAA-0232鑒定為Boeremiafoveata(Foister)Aveskamp,Gruyter & Verkley。
Boeremia屬是Aveskamp等于2010年建立的新屬[8-9]。Aveskamp 等 采 用 多 位 點(diǎn) 序 列 分 型 法(multilocus sequence type,MLST)對(duì)206個(gè)分類單元(其中159個(gè)分類單元已知與Phoma關(guān)系密切)的378個(gè)菌株的LSU、SSU、ITS、TUB基因進(jìn)行了多重分析,依據(jù)系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果并結(jié)合形態(tài)學(xué),建立了新屬BoeremiaAveskamp,Gruyter&Verkley,8個(gè)新種,2個(gè)新變種,61個(gè)新組合。馬鈴薯壞疽病病原被新組合為Boeremiafoveata,該菌隸屬于子囊菌門(Ascomycota),盤菌亞門(Pezizomycotina),座囊菌綱(Dothideomycetes),格孢菌亞綱(Pleosporomycetidae),格孢腔菌目 (Pleosporales),Didymellaceae科,Boeremia屬:
Boeremiafoveata(Foister) Aveskamp,Gruyter&Verkley 2010[Legitimate;MB515653]
Basionym :PhomafoveataFoister 1940 [Legitimate;MB289414]
Obligate synonym(s):
PhomafoveataFoister 1940 [Legitimate;MB289414]
Phomaexiguavar.foveata(Foister)Boerema 1967[Legitimate;MB350008]
Phomasolanicolavar.foveata(Foister)Malcolmson 1940[Legitimate;MB494129]
Phomasolanicolaf.foveata(Foister)Malcolmson 1958[Legitimate;MB350016]
Boeremiafoveata(=Phomafoveata)最早發(fā)現(xiàn)于蘇格蘭的馬鈴薯塊莖[10],之后在秘魯?shù)陌柕倨绽Z高原地區(qū)的昆諾藜(Chenopodiumquinoa)上發(fā)現(xiàn)該菌,并認(rèn)為南美高原可能是該菌的地理發(fā)源地[11]。
Boeremiafoveata引起的壞疽病是馬鈴薯貯藏期的重要病害,也是重要的檢疫性病害,已發(fā)生于澳洲、歐洲、北美洲和南美洲,病菌在土壤中可存活多年[12-13]。病菌還可侵染馬鈴薯的莖,病莖較健康莖早衰[14]。
在蘇格蘭,引起馬鈴薯塊莖壞疽病和干腐病的病原中,Boeremiafoveata引發(fā)病害的腐爛指數(shù)最高,其腐爛指數(shù)較Boeremiaexigua(=Phomaexigua)高出5倍,較Phomaeupyrena高出10倍[15]。在澳大利亞的塔斯馬尼亞,馬鈴薯壞疽病病原中,Boeremiaexiguavar.exigua(=Phomaexiguavar.exigua)所占比率為90%,Boeremiafoveata所占比率為10%[16]。
Boeremiaexiguavar.exigua是多主寄生真菌,已報(bào)道從超過200個(gè)屬的植物上分離到該菌,且無寄主?;F(xiàn)象[17]。在我國,梁力哲從辣椒種子上也分離到了該菌[18]。
由于Boeremiafoveata和Boeremiaexiguavar.exigua在形態(tài)特征上相似,而一些Boeremia foveata分離物又會(huì)喪失產(chǎn)生特征性蒽醌色素的能力[19],給種類鑒定帶來了困難。隨著現(xiàn)代生物技術(shù)的發(fā)展,一些分子檢測鑒定技術(shù)被用于Boeremia foveata的輔助鑒定[20-21],其中 Macdonald等的方法具有較好的可重復(fù)性。本研究即采用Macdonald等的方法對(duì)病菌進(jìn)行了分子生物學(xué)鑒定。
雖然馬鈴薯壞疽病具有較典型的病斑下陷、病健界限明顯等特征性癥狀,但在實(shí)際操作中,壞疽病與鐮刀菌引起的干腐病還是很容易混淆[22]。
本研究中,馬鈴薯壞疽病病薯率較低,3批次樣本的病薯率均低于1%。
這是Phomafoveata引起馬鈴薯壞疽病在我國的首次報(bào)道。研究菌株保存于甘肅省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所病害研究室。
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Identification of the pathogen of potato tuber gangrene in Gansu Province
Wen Zhaohui1, He Suqin2, Jing Zhuoqiong2
(1.GansuEntry-ExitInspectionandQuarantineBureau,Lanzhou730020,China;2.InstituteofPlantProtection,GansuAcademyofAgricultural Sciences,Lanzhou730070,China)
The pathogen of potato tuber gangrene in Gansu Province was identified through Koch’s rule and morphological characteristics,and specific fragment DNA sequence by using the specific primers Phoma-2/Phoma-7.Totally 5 strains were isolated from the diseased potato tubers with typical gangrene symptoms in Lanzhou City of Gansu Province in 2002 and 2009,and the pathogenicity was confirmed by Koch’s rule.A474-bp DNA fragment was amplified from the strain GSAA-0232 by using the specific primers Phoma-2/Phoma-7.The fungus produced an yellowish-brown anthraquinone pigment in culture,showing purplish red colour as well as drop of NaOH.Based on morphological characteristics,biological features,pathogenicity and molecular specialities(GenBank accession:JQ963624),the pathogen was identified asBoeremiafoveata(Foister)Aveskamp,Gruyter &Verkley.This is the first report of potato gangrene caused byB.foveatain China.
potato; gangrene;Boeremiafoveata;Phomafoveata
S 435.32
A
10.3969/j.issn.0529-1542.2012.05.008
2012-05-01
2012-05-23
* 通信作者E-mail:gshesuqin@sina.com