王 冰, 尹 姣, 李克斌, 曹雅忠
(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,植物病蟲害生物學(xué)國家重點(diǎn)實驗室,北京 100193)
昆蟲在長期進(jìn)化過程中形成靈敏的嗅覺機(jī)制,以適應(yīng)復(fù)雜多變的環(huán)境條件,從而得以生存繁衍。昆蟲對氣味分子的識別和鑒定包括一系列的過程,即脂溶性小分子化合物的氣味物質(zhì)借助氣味結(jié)合蛋白(odorant-binding proteins,OBPs)等小分子量觸角蛋白的攜帶,穿過氣—液相界面到達(dá)嗅覺受體(olfactory receptors,ORs),在觸角嗅覺受體內(nèi)完成對氣味的識別[1-2]。1981年昆蟲氣味分子結(jié)合蛋白的發(fā)現(xiàn)以及其功能探討,邁出了對嗅覺機(jī)制研究的第一步[3]。1991年,Buck和Axel首次在哺乳動物鼠中分離出了嗅覺受體[4]。而昆蟲嗅覺受體的研究起步較晚,1999年在黑腹果蠅(Drosophila mela-nogaster)中發(fā)現(xiàn)了第一個昆蟲氣味受體[5],為昆蟲嗅覺蛋白功能的研究以及氣味分子識別機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。昆蟲氣味受體分為傳統(tǒng)氣味受體(conventional receptor)和OrCo(曾經(jīng)被稱為Or83b)受體(olfactory receptor coreceptor)[6]。前 者 基 因 在 不同昆蟲間同源性較低,目前已有的研究顯示只在較小部分昆蟲物種間獲得;而后者基因是一類非典型氣味受體,在不同種間高度保守,與傳統(tǒng)的氣味受體共同行使嗅覺功能[7-9]。同時也有研究表明,OrCo受體對傳統(tǒng)的氣味受體在膜結(jié)構(gòu)上的正確定位起著不可或缺的作用[10]。
近年來,由于作物種植結(jié)構(gòu)和耕作制度的調(diào)整等原因?qū)е碌叵潞οx頻頻暴發(fā),對我國的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)安全造成重大的威脅[11]。鞘翅目金龜甲類昆蟲是國內(nèi)外公認(rèn)的難以防治的土棲性害蟲,其中比較特殊的類群—華北大黑鰓金龜[Holotrichia oblita(Faldermann)]在我國發(fā)生相當(dāng)嚴(yán)重,是金龜子類害蟲中防治的難點(diǎn)[12]。金龜子類害蟲的幼蟲主要集中在地下危害,防治困難,而成蟲一般在地面活動,防治方法相對簡便,因此,尋求對成蟲的有效防治方法成為了科學(xué)家們近年來研究的熱點(diǎn)。金龜子在尋找寄主、配偶,搜尋產(chǎn)卵及生殖場所等過程中,蟲體同外界的化學(xué)信息交流密切,其中嗅覺在此過程中具有重要的作用[13]。因此,對其成蟲嗅覺系統(tǒng)的深入研究可成為控制其幼蟲為害的突破點(diǎn)。目前,現(xiàn)有的研究發(fā)現(xiàn),昆蟲對成千上萬種氣味分子的識別主要依賴于氣味受體介導(dǎo)的氣味分子與嗅覺神經(jīng)的專一性結(jié)合。因此,研究氣味受體的特性、變異及專一性對于闡明嗅覺識別的分子機(jī)理是非常重要的[14-15]。本研究采用PCR克隆和RACE延伸技術(shù)獲得了華北大黑鰓金龜子非典型受體蛋白OrCo基因,并對其進(jìn)行序列分析,為深入研究華北大黑鰓金龜嗅覺機(jī)制打下基礎(chǔ)。
試蟲華北大黑鰓金龜成蟲于2011年5月在河北省滄州市郊區(qū)采集。將試蟲成蟲的觸角用刀片切下,立即置于液氮中速凍,之后于-80℃保存。
總RNA提取試劑Trizol購自Invitrogen公司;PrimeScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit、5′-Full RACE Kit、3′-Full RACE Core Set Ver.2.0、Agarose Gel DNA Purification Kit Ver.2.0試劑盒、LA Taq酶購自寶生物工程有限公司(TaKaRa);感受態(tài)細(xì)胞Trans5αChemically Competent Cell購自全式金公司;pGEM-T Easy vector購自Promega公司;抗生素類、X-gal、IPTG購自Sigma公司;其余試劑均為國產(chǎn)或進(jìn)口分析純試劑。引物合成由上海生工公司完成;測序由華大基因生物技術(shù)公司完成。
1.3.1 華北大黑鰓金龜觸角總RNA的提取
取50頭華北大黑鰓金龜成蟲,剪下觸角,于液氮中研磨,根據(jù)Trizol提取RNA說明書提取總RNA,之后加入RNase-free水30μL,立即進(jìn)行cDNA第1鏈合成或-80℃保存。
1.3.2 cDNA第1鏈合成
以總RNA為模板,按照PrimeScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit說明書進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,合成cDNA第1鏈。反應(yīng)步驟如下:將下列物質(zhì)混合:Oligo dT Primer(50μmol/L)1μL,dNTP 1μL,總 RNA 6μg,RNase free dH2O 2μL,之后在PCR儀上進(jìn)行65℃5min變性、退火反應(yīng),于冰上急冷。配制反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液,包括5×PrimeScriptTMBuffer 4μL,RNase Inhibitor(40U/μL)0.5μL,PrimeScriptTMRTase(200U/μL)1μL,上述變性、退火后反應(yīng)液10μL,RNase Free dH2O 4.5μL,在PCR儀上按下列條件進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng):42℃60min,70℃15min,冰上放置。將合成的cDNA于-20℃保存。
1.3.3 引物設(shè)計與合成
根據(jù)GenBank中已經(jīng)登錄的近緣種金龜子Or-Co基因的保守區(qū)域,利用引物設(shè)計軟件Primer Premier 5設(shè)計相應(yīng)的簡并引物,用于擴(kuò)增華北大黑鰓金龜OrCo受體基因的cDNA片段。3′RACE和5′RACE引物是根據(jù)cDNA擴(kuò)增片段獲得的序列而進(jìn)一步設(shè)計的。最后設(shè)計特異性引物擴(kuò)增OrCo受體基因的全長。引物序列見表1。
表1 擴(kuò)增華北大黑鰓金龜OrCo基因所用引物
1.3.4 PCR擴(kuò)增和RACE反應(yīng)
以合成的cDNA為模板,選用LATaq酶擴(kuò)增。混勻下列成分:合成的cDNA 2.5ng,dNTP Mixture 8μL(各2.5mmol/L),10×LA PCR BufferⅡ(Mg2+free)5μL,25mmol/L MgCl25μL,正向引物和反向引物各1μL(20μmol/L),LA Taq DNA 聚 合 酶(5U/μL)0.5μL,加滅菌蒸餾水至50μL,放入PCR儀進(jìn)行擴(kuò)增。PCR反應(yīng)條件:94℃變性5min;30個循環(huán)條件為94℃30s,55℃30s,72℃1min的循環(huán);72℃延伸10min。
RACE 反應(yīng)參照5′-Full RACE Kit和 3′-Full RACE Core Set Ver.2.0說明書。擴(kuò)增的產(chǎn)物用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測并對目的片段進(jìn)行回收。
1.3.5 PCR產(chǎn)物克隆及序列測定
按說明書的說明,將PCR回收產(chǎn)物連接到pGEM-T Easy vector上,然后轉(zhuǎn)化到大腸桿菌Trans5αChemically Competent Cell,進(jìn)行藍(lán)白斑篩選,挑取陽性克隆,之后送公司測序。
1.3.6 序列分析
Blast同源性搜索在NCBI網(wǎng)站進(jìn)行,序列分析由DNAman軟件完成,跨膜域預(yù)測由TMHMM程序(http:∥www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM)完成。多序列同源性比對和結(jié)果輸出應(yīng)用Clustal 2.0.7軟件進(jìn)行。昆蟲氣味受體進(jìn)化樹的構(gòu)建使用Mega4.1軟件進(jìn)行。
以反轉(zhuǎn)錄獲得的cDNA為模板,利用簡并引物對其進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲得450bp左右的片段,與pGEMT Easy vector連接,并轉(zhuǎn)化大腸桿菌Trans5α細(xì)胞,對其進(jìn)行菌液PCR,檢測片段大小正確后測序。獲得的片段序列在NCBI網(wǎng)站上進(jìn)行BLAST同源搜索,比對結(jié)果顯示該片段與鞘翅目嗅覺受體基因高度同源。根據(jù)獲得的序列分別設(shè)計3′-RACE和5′-RACE所需的特異性引物(見表1),并根據(jù)說明書進(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)果得到了580bp和1 300bp的特異性條帶,同樣將這些片段進(jìn)行連接,轉(zhuǎn)化與測序。
根據(jù)3′-RACE和5′-RACE測序結(jié)果,拼接獲得一個編碼華北大黑鰓金龜OrCo的cDNA序列。同時,我們設(shè)計了1對特異性引物(見表1)來證明PCR,3′-RACE和5′-RACE片段是來源于同一個基因,PCR擴(kuò)增得到了一條全長為1 598bp的序列,測序結(jié)果與拼接結(jié)果一致(圖1)。該序列蛋白編碼區(qū)長1 434bp,5′非翻譯區(qū)長203bp,3′非翻譯區(qū)不完整,但是得到了終止密碼子TAA以及多聚腺苷酸信號序列,因此蛋白編碼區(qū)是完整的。
圖1 華北大黑鰓金龜OrCo基因(Hobl/OrCo)PCR擴(kuò)增結(jié)果
將克隆獲得的華北大黑鰓金龜cDNA全長序列命名為Hobl/OrCo,并在GenBank注冊,登錄號為:JF718 662。如圖2所示,Hobl/OrCo基因的核苷酸序列全長共1 598bp,開放閱讀框全長1 434bp,編碼477個氨基酸。根據(jù)網(wǎng)站http:∥www.expasy.ch/tools/protparam.html預(yù)測其分子量為54.54ku,等電點(diǎn)為7.65??缒そY(jié)構(gòu)分析(http:∥www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM)表明,Hobl/OrCo基因推斷的氨基酸序列具有7個α螺旋跨膜區(qū),跨膜位置分別為37~59、74~96、135~157、194~216、339~361、381~403、451~473(圖3),類似于一個典型的G蛋白偶聯(lián)受體。
圖2 華北大黑鰓金龜Hobl/OrCo核苷酸序列及推導(dǎo)的氨基酸序列
圖3 華北大黑鰓金龜Hobl/OrCo跨膜區(qū)預(yù)測
以往的研究表明OrCo受體在昆蟲進(jìn)化過程中高度保守,因此選取已知近緣種鞘翅目的鉛灰齒爪鰓金龜(Hplu/OrCo)、赤擬谷盜(Tcas/OrCo)和黃曲條跳甲(Pstr/OrCo),以及鱗翅目、雙翅目和膜翅目具有代表性的昆蟲與其進(jìn)行序列聯(lián)配。結(jié)果顯示,Hobl/Or-Co基因的氨基酸序列與近緣種鉛灰齒爪鰓金龜(Hplu/OrCo)的同源性高達(dá)95.39%,與鞘翅目赤擬谷盜(Tcas/OrCo)同源性高達(dá)80.71%,與已經(jīng)報道的其他昆蟲的嗅覺受體同源性在76%以上,尤其在C端保守性非常高,這與以往的研究高度吻合(圖4)。
利用Mega 4.1軟件[16]構(gòu)建了鱗翅目、鞘翅目、膜翅目、雙翅目部分昆蟲非典型氣味受體的系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖5)。經(jīng)1 000次重復(fù)后,該進(jìn)化樹非常直觀地呈現(xiàn)出4個目昆蟲之間的進(jìn)化關(guān)系。結(jié)果顯示,22個OrCos分成2個大的分支,其中雙翅目和鞘翅目昆蟲處于一個分支上,而膜翅目和鱗翅目昆蟲處于另一個大分支上,說明相對于膜翅目和鱗翅目而言,雙翅目與鞘翅目在OrCo上的親緣關(guān)系較近。這4個目的氣味受體序列均表現(xiàn)得相對較為保守,未出現(xiàn)較大的分化。在鞘翅目中,大黑鰓金龜(Hobl/Or-Co)與鉛灰齒爪鰓金龜(Hplu/OrCo)的非典型氣味受體親緣關(guān)系很近,與黃曲條跳甲(Pstr/OrCo)則相對遠(yuǎn)些,這與序列聯(lián)配的結(jié)果相一致。
對果蠅(Drosophila melanogaster)、岡比亞按蚊(Anopheles gambiae)、意大利蜜蜂(Apis mellifera)、煙芽夜蛾(Heliothis virescens)、家蠶(Bombyx mori)、埃及伊蚊(Aedes aegypti)和赤擬谷盜(Tribolium castaneum)等多種昆蟲研究發(fā)現(xiàn),普通氣味受體基因在昆蟲中同源性很低[9,17-24]。但是另一類非典型氣味受體基因OrCo則不同,這類基因在不同昆蟲體內(nèi)高度保守[25]。目前,已經(jīng)在鱗翅目、膜翅目、鞘翅目、雙翅目[22,26-27]等4個目昆蟲中發(fā)現(xiàn) Or-Co的存在。本研究利用基因克隆技術(shù)成功獲得了華北大黑鰓金龜OrCo基因的cDNA全長序列,并進(jìn)行了序列分析,獲得的氨基酸序列與近緣種鉛灰齒爪鰓金龜嗅覺受體的同源性高達(dá)95%以上,與鞘翅目赤擬谷盜的同源性高達(dá)80%以上,這些都與OrCo基因在不同昆蟲體內(nèi)的高度保守性相吻合[28-33]。
目前研究顯示OrCo可加速受體與氣味分子間的相互作用[8-9,22,34],并能輔助傳統(tǒng)氣味受體正確定位到嗅覺神經(jīng)元樹突膜上[8]。OrCo基因與傳統(tǒng)氣味受體間的互作研究,有助于發(fā)掘和研究傳統(tǒng)氣味受體的相關(guān)功能,為進(jìn)一步探索受體在氣味識別過程中所起的作用和功能提供了理論基礎(chǔ)。但是,完整的嗅覺受體信號傳導(dǎo)機(jī)制尚不清楚[35]。2008年在《nature》發(fā)表的兩篇文章提出了一種新的嗅覺傳導(dǎo)模型,即OR-OrCo和氣味化合物共同控制的離子通道[36-37]。該研究顯示昆蟲的化學(xué)傳導(dǎo)機(jī)制可能與其他脊椎動物的有所不同。經(jīng)典的G蛋白偶聯(lián)受體的膜拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)呈現(xiàn)為:蛋白的N末端位于細(xì)胞膜外,C末端位于細(xì)胞膜內(nèi)。然而,果蠅的膜拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)則與傳統(tǒng)的G蛋白偶聯(lián)受體相反,這樣與配體結(jié)合的ORs就受到了更多的限制[34]。如果所有果蠅的ORs都呈現(xiàn)出反向G蛋白偶聯(lián)受體的特征,那么它們將代表另一種7個跨膜結(jié)構(gòu)域蛋白家族。同時,它們的信號傳導(dǎo)途徑可能與G蛋白偶聯(lián)受體不同,可能利用磷脂肌醇(IP3)信號通路抑或是環(huán)核苷酸信號通路將配體信息傳導(dǎo)到受體神經(jīng)元上,刺激電生理活動[38]。因此,當(dāng)嗅覺受體與氣味配體結(jié)合后是如何傳導(dǎo)信號的尚需進(jìn)一步的研究與驗證。
華北大黑鰓金龜OrCo受體的成功克隆,對進(jìn)一步研究華北大黑鰓金龜氣味受體的功能以及解析嗅覺機(jī)制具有重要的意義。同時,從應(yīng)用角度來看,由于OrCo基因在昆蟲中普遍存在以及其在嗅覺機(jī)制中的重要性,使其成為切斷嗅覺識別途徑的分子靶標(biāo),對其深入研究將為農(nóng)業(yè)害蟲的防控提供新的理論基礎(chǔ),并具有一定的實踐意義。
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