王冬梅 陳 琛,2 王慶彪 莊 木* 劉玉梅 楊麗梅張揚(yáng)勇 方智遠(yuǎn)
(1中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所,北京 100081;2青島農(nóng)業(yè)大學(xué),山東 青島 266109)
芥藍(lán)(Brassica oleracea var. alboglabra Baily),又名白花芥藍(lán)、芥蘭,是十字花科蕓薹屬一年或兩年生草本植物,2n=18,在我國廣東、廣西、福建和臺灣等地廣泛種植(Panda et al.,2003;秦耀國 等,2009;張平真,2009;周禹 等,2010)。有關(guān)甘藍(lán)類作物起源和親緣關(guān)系的信息多數(shù)來自史料記載(Helm,1963;Thompson,1976;張平真,2009):普通結(jié)球甘藍(lán)和紫甘藍(lán)大約在13世紀(jì)起源于德國;皺葉甘藍(lán)可能原產(chǎn)于意大利;抱子甘藍(lán)形成于比利時的布魯塞爾;Boswell(1949)認(rèn)為球莖甘藍(lán)是15世紀(jì)在歐洲北部演化而成;花椰菜可能是在1490年由熱那亞人從黎凡特或者塞浦路斯引入意大利;青花菜由黎凡特、塞浦路斯或者克里特島引入意大利;芥藍(lán)的起源有中國南方起源說和地中海沿岸起源說兩種,尚缺乏充分的分子生物學(xué)證據(jù)。
SSR標(biāo)記由于其多態(tài)性好以及共顯性的特點(diǎn)(Powell et al.,1996),越來越多地應(yīng)用于基因標(biāo)記、圖譜構(gòu)建、遺傳多樣性分析等方面(陳全求 等,2008)。與基因組SSR相比,EST-SSR作為功能基因的一部分,在功能基因鑒定和種間通用性上更有其優(yōu)越性(Gupta et al.,2003)。本試驗(yàn)利用甘藍(lán) EST-SSR標(biāo)記,對芥藍(lán)、野生甘藍(lán)、觀賞羽衣甘藍(lán)、苤藍(lán)、皺葉甘藍(lán)、結(jié)球甘藍(lán)、紫甘藍(lán)、抱子甘藍(lán)、青花菜和花椰菜等甘藍(lán)類材料進(jìn)行遺傳多樣性分析,比較芥藍(lán)與其他甘藍(lán)類作物之間的親緣關(guān)系,為芥藍(lán)起源提供分子證據(jù)。
供試材料包括甘藍(lán)類作物自交系、地方品種、一代雜種和野生甘藍(lán)等38份。其中3份野生甘藍(lán)由英國國際園藝研究中心(Warwick HRI,UK)引進(jìn),5份芥藍(lán)地方品種由華南農(nóng)業(yè)大學(xué)雷建軍教授提供,花椰菜由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所花椰菜課題組提供,其余材料由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所甘藍(lán)課題組收集、提供(材料編號和名稱見表 1)。所有材料于2009、2010年定植于中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所南口實(shí)驗(yàn)農(nóng)場,在芥藍(lán)成熟期調(diào)查其植物學(xué)性狀,調(diào)查標(biāo)準(zhǔn)參照《芥藍(lán)種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)》(李錫香和方智遠(yuǎn),2008)。苗期取幼嫩葉片,采用改良CTAB法提取DNA。
表1 供試38份甘藍(lán)類材料名稱、類型及來源
試驗(yàn)所用EST-SSR引物參見陳琛等(2010)的文獻(xiàn),利用8份不同甘藍(lán)變種的材料進(jìn)行引物初篩,篩選出61對EST-SSR引物,并對所有38份材料進(jìn)行擴(kuò)增分析。PCR反應(yīng)體系為10μL,其中包括:200μmol·L-1dNTPs,上鏈和下鏈引物各2.5 pmol,0.5 U Taq酶,1×Buffer(內(nèi)含1.5mmol·L-1MgCl2),25 ng DNA模板,所用試劑均購自北京博邁德科技發(fā)展有限公司。PCR擴(kuò)增反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性4min;94 ℃變性30 s,合適溫度退火30 s,72 ℃延伸1min,35個循環(huán);72 ℃延伸7min。各引物的合適退火溫度根據(jù)引物合成報告單而定。8 %聚丙烯酰胺凝膠電泳分離PCR產(chǎn)物,160 V恒壓。快速銀染法染色。
在相同遷移率位置上,有帶記為1,無帶記為0,缺失記為999。為保證數(shù)據(jù)準(zhǔn)確、可靠,每塊膠板均由兩人獨(dú)立記錄,然后比對,有爭議的數(shù)據(jù)作缺失處理。應(yīng)用NTSYSpc2.11軟件采用非加權(quán)類平均法(UPGMA)進(jìn)行聚類分析,得到遺傳相似系數(shù),根據(jù)遺傳相似系數(shù)建立聚類圖。
本試驗(yàn)利用8個具有代表性的材料對EST-SSR引物多態(tài)性進(jìn)行篩選,共得到61對擴(kuò)增穩(wěn)定、條帶清晰、品種間帶型差異較明顯、易于識別的引物。用這61對EST-SSR引物對38份甘藍(lán)類材料擴(kuò)增,共擴(kuò)增出174條多態(tài)性條帶,每對引物擴(kuò)增的等位位點(diǎn)數(shù)不等,變幅為1~5,平均每對引物擴(kuò)增2.86條帶,引物多態(tài)性總體較好。其中,引物BoE332在38份材料中的擴(kuò)增結(jié)果見圖1。
圖1 引物BoE332在部分甘藍(lán)類作物中的SSR擴(kuò)增結(jié)果
根據(jù)擴(kuò)增結(jié)果建立數(shù)據(jù)矩陣后用NTSYSpc2.11軟件計(jì)算不同甘藍(lán)變種間的遺傳相似系數(shù),UPGMA法進(jìn)行聚類分析得到38份甘藍(lán)類材料的聚類分析樹狀圖(圖2)。
由圖2可知,在相似系數(shù)大約為0.62處,所選甘藍(lán)材料按地域分為三大類群:Ⅰ野生甘藍(lán)、觀賞羽衣甘藍(lán)、結(jié)球甘藍(lán)、紫甘藍(lán)、皺葉甘藍(lán)、苤藍(lán)和抱子甘藍(lán)。這幾類除皺葉甘藍(lán)外,其他的在史料記載中均起源于歐洲西北部沿海地區(qū)。Ⅱ青花菜和花椰菜。起源于地中海沿岸。Ⅲ芥藍(lán)。首先作為一個單獨(dú)的類群聚出,表明其與前兩大類群的甘藍(lán)類植物在進(jìn)化途徑上有所不同,推測其起源于中國南方。
在相似系數(shù)約為0.77處,13份芥藍(lán)材料可分為三類(圖2)。東升芥藍(lán)(38)是一高代自交系,聚為第一類。桃山中花(31)可葉、薹兼用,本地鐵種(32)為葉用芥藍(lán),均表現(xiàn)為葉形橢圓、葉面平滑,聚為第二類。其余為第三類,這類材料除長葉中熟(35)葉形為橢圓外,其他材料特點(diǎn)是葉形寬卵圓,葉面皺縮;老種香菇(34)、長葉中熟為薹用類型,其中長葉中熟的主薹為紫紅色,側(cè)薹商品性好;日本綠(36)來自于日本,與老種香菇、長葉中熟的親緣關(guān)系較近;香港遲花(37)來自香港,與矮腳筷(33)的親緣關(guān)系較近。芥藍(lán)的植物學(xué)性狀見表2。
圖2 基于EST-SSR分析的38份甘藍(lán)類材料聚類樹狀圖
表2 芥藍(lán)植物學(xué)性狀調(diào)查結(jié)果
本試驗(yàn)將芥藍(lán)分為三類,除高代自交系東升芥藍(lán)獨(dú)為一類外,其他兩類與Okuda和Fujime(1996)根據(jù)植物學(xué)性狀的分類結(jié)果及Matsui等(2002)的RAPD分析結(jié)果基本一致,主要是根據(jù)葉形和葉面進(jìn)行分類。
芥藍(lán)的起源現(xiàn)存有兩種觀點(diǎn),一是中國南方起源說,在中國目前能追溯到的最早有關(guān)芥藍(lán)的記載是宋朝蘇東坡(1037~1101)的詩句“芥蘭如菌蕈,脆美牙頰響”,距今已有 900多年的歷史;而《中國蔬菜栽培學(xué)》(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所,1987)記載最早引進(jìn)中國的結(jié)球甘藍(lán)和花椰菜,也只有300余年的歷史,說明芥藍(lán)可能原產(chǎn)于中國;張平真(2009)綜合了各種史學(xué)資料認(rèn)為芥藍(lán)為甘藍(lán)的一個變種,并支持芥藍(lán)起源于中國南方的說法。二是地中海沿岸地區(qū)起源說,支持這一學(xué)說代表著作有《植物學(xué)》(中山大學(xué)和南京大學(xué),1984)和《中國的蔬菜》(章厚樸,1988)。本試驗(yàn)中芥藍(lán)首先作為一個單獨(dú)的類群與其他甘藍(lán)類作物分開,表明芥藍(lán)與其他甘藍(lán)類作物可能是由不同路線進(jìn)化而來。野生甘藍(lán)、觀賞羽衣甘藍(lán)、皺葉甘藍(lán)、結(jié)球甘藍(lán)、紫甘藍(lán)、苤藍(lán)、抱子甘藍(lán)起源于歐洲西北部沿海地區(qū);青花菜和花椰菜起源于地中海沿岸;芥藍(lán)獨(dú)立于歐洲西北部類群和地中海沿岸類群,推測其可能起源于中國。有記載早在公元前5、6世紀(jì),一種被稱為“西土藍(lán)”的甘藍(lán)類作物傳入中國(張平真,2006),在我國副熱帶氣候條件下,逐漸選育形成芥藍(lán);Song等(1988)的 RFLP研究中芥藍(lán)為單獨(dú)一類,與千頭羽衣甘藍(lán)親緣關(guān)系較近,被認(rèn)為是一種較為原始的類型,可能起源于一種由西歐傳到東亞的原始羽衣甘藍(lán);本試驗(yàn)中芥藍(lán)作為一個單獨(dú)的類群首先聚出,與其他甘藍(lán)材料的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),可能是芥藍(lán)進(jìn)化形成時間較早,且進(jìn)化形成的地域與其他甘藍(lán)類作物隔離,支持芥藍(lán)起源于中國的說法。本試驗(yàn)中選用的野生甘藍(lán)都屬于Brassica oleracea,全部來自英國,均聚于歐洲西北部沿海類群,表明羽衣甘藍(lán)、皺葉甘藍(lán)、結(jié)球甘藍(lán)、紫甘藍(lán)、苤藍(lán)、抱子甘藍(lán)可能都起源于野生甘藍(lán)(Brassica oleracea);而至于芥藍(lán)的祖先,還需進(jìn)一步收集范圍更廣的野生甘藍(lán)和近緣野生二倍體進(jìn)行分析。
陳琛,莊木,李康寧,劉玉梅,楊麗梅,張揚(yáng)勇,程斐,孫培田,方智遠(yuǎn).2010.甘藍(lán)EST-SSR標(biāo)記的開發(fā)與應(yīng)用.園藝學(xué)報,37(2):211-228.
陳全求,詹先進(jìn),藍(lán)家樣,黃云.2008.EST分子標(biāo)記開發(fā)研究進(jìn)展.農(nóng)業(yè)生物技術(shù)科學(xué),24(9):72-77.
李錫香,方智遠(yuǎn).2008.芥藍(lán)種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn).北京:中國農(nóng)業(yè)出版社.
秦耀國,楊翠芹,曹必好,陳國菊,雷建軍.2009.芥藍(lán)遺傳育種與生物技術(shù)研究進(jìn)展.中國農(nóng)學(xué)通報,25(18):296-299.
章厚樸.1988.中國的蔬菜.北京:人民出版社.
張平真.2006.中國蔬菜名稱考釋:甘藍(lán)類蔬菜.北京:北京燕山出版社.
張平真.2009.關(guān)于芥藍(lán)起源的研究.中國蔬菜,(14):62-65.
中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所.1987.中國蔬菜栽培學(xué).北京:農(nóng)業(yè)出版社.
中山大學(xué),南京大學(xué).1984.植物學(xué).北京:人民教育出版社.
周禹,李燕,孫勃,石瑜,汪俏梅,汪炳良.2010.芥藍(lán)與甘藍(lán)其他變種分類關(guān)系的研究.園藝學(xué)報,37(7):1161-1168.
Boswell V R.1949.Our vegetable travelers.Natl Geogr Mag,96:145-217.
Gupta P K,Rustgi S,Sharma S,Singh R,Kumar N,Balyan H S.2003.Transferable EST-SSR marker for the study of polymorphism and genetic diversity in bread wheat.Mor Gen Genomics,270:315-323.
Helm J.1963.Morphologisch-taxonomische Gliederung der kultursippen von Brassica oleracea.Kulturplfanzen,11:92-210.
Matsui T,Okuda N,Kosugi Y.2002.Classification of Chinese kale cultivars by RAPD analysis.Journal of the Japanese Society for Horticultural Science,71(4):499-503.
Okuda N,F(xiàn)ujime Y.1996.Plant growth characters of Chinese kale (Brassica oleracea L. var. alboglabra).Acta Horticulturae,407:55-59.
Panda S,Martin J P,Aguinagalde I.2003.Chloroplast and nuclear DNA studies in a few members of the Brassica oleracea L. group using PCR-RFLP and ISSR-PCR markers:a population genetic analysis.Theor Appl Genet,106(6):1122-1128.
Powell W,Machray G C,Provan J.1996.Polymorphism revealed by simple sequence repeats.Trends Plant Sci,7(2):215-222.
Song K M,Osborn T C,Williams pH.1988.Brassica taxonomy based on nuclear restriction fragment length polymorphisms(RFLPs).1.Genome evolution of diploid and amphidiploid species.Theor Appl Genet,75:784-794.
Thompson K E.1976.Cabbage,kale,etc//Simmonds N W.Evolution of crop plants.New York:Longman:49-52.