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    人類白細(xì)胞介素10基因-592C/A多態(tài)性與SLE相關(guān)性研究

    2011-01-24 08:38:36任小英任麗玲王莉武永康
    中國(guó)醫(yī)藥指南 2011年4期
    關(guān)鍵詞:電泳多態(tài)性基因型

    任小英 李 燕 任麗玲 王莉 武永康*

    (1 成都市第一人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,四川 成都 610041;2 四川大學(xué)華西醫(yī)院實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)科,四川 成都 610041;3 成都市老年病醫(yī)院,四川 成都 611130;4 中國(guó)人民解放軍第452醫(yī)院婦產(chǎn)科,四川 成都 610041)

    人類白細(xì)胞介素10基因-592C/A多態(tài)性與SLE相關(guān)性研究

    任小英1李 燕2任麗玲3王莉4武永康2*

    (1 成都市第一人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,四川 成都 610041;2 四川大學(xué)華西醫(yī)院實(shí)驗(yàn)醫(yī)學(xué)科,四川 成都 610041;3 成都市老年病醫(yī)院,四川 成都 611130;4 中國(guó)人民解放軍第452醫(yī)院婦產(chǎn)科,四川 成都 610041)

    目的系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)是一種復(fù)雜的與遺傳密切相關(guān)的免疫炎癥性自身免疫疾病。而人類白細(xì)胞介素10(human interleukin-10,IL-10)被認(rèn)為是體內(nèi)最重要的抑炎細(xì)胞因子,其對(duì)炎性反應(yīng)的調(diào)控起非常重要的作用,IL-10在SLE患者體內(nèi)顯著升高。本研究主要針對(duì)IL-10基因-592C/A多態(tài)性與SLE發(fā)病的關(guān)聯(lián)性進(jìn)行分析。方法抽取145例SLE患者和80例健康對(duì)照者全血標(biāo)本,提取患者DNA,采用PCR和酶切、電泳的方法得到IL-10基因-592C/A位點(diǎn)多態(tài)性分布頻率。結(jié)果SLE患者IL-10基因-592C/A位點(diǎn)基因型分布和基因型頻率分布與健康對(duì)照者差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。結(jié)論IL-10基因-592C/A多態(tài)性與SLE易感性無(wú)關(guān)。

    IL-10;基因多態(tài)性;SNP;SLE

    系統(tǒng)性紅斑狼瘡(systemic lupus erythematosus,SLE)是一種臨床上常見的、復(fù)雜的自身免疫性疾病,被稱為自身免疫性疾病的原型?;颊咄怀霰憩F(xiàn)為有自身抗體的產(chǎn)生并通過(guò)免疫復(fù)合物等途徑造成周身多系統(tǒng)、多器官都可受累。腎功能衰竭、感染、中樞神經(jīng)損傷是其死亡的主要原因,其病因、發(fā)病機(jī)制尚未完全清楚。目前普遍認(rèn)為是環(huán)境因素(毒物、飲食、感染等)作用于一定的遺傳背景的機(jī)體造成自身免疫損傷[1]。近年來(lái)雖有研究證實(shí)EB病毒[2]、吸煙和化學(xué)殺蟲劑等有害環(huán)境以及藥物[3]在SLE的發(fā)病過(guò)程中起一定作用,但普遍認(rèn)為遺傳因素起關(guān)鍵作用。SLE具有很強(qiáng)的遺傳傾向,有研究表明,SLE的同胞患病率是一般人群的29倍[4],同卵雙生子發(fā)病一致率為24%~58%,異卵雙生子的發(fā)病一致率為2%~5%[5],流行病學(xué)顯示:SLE患者一級(jí)親屬中的女性SLE患病率是2.64%,而正常人群為0.4%,SLE患者一級(jí)親屬中非SLE自身免疫性疾病發(fā)病率也明顯高于正常人群[6]。

    人類SLE致病因素涉及到多種基因和基因組結(jié)構(gòu)的變化?;蚪MDNA隨著細(xì)胞的增值過(guò)程不斷被復(fù)制,其間DNA本身處于損傷和修復(fù)的動(dòng)態(tài)變化中,其中未被修復(fù)而保留的突變構(gòu)成了許多疾病的發(fā)病機(jī)制。大量存在于基因組的可遺傳變異,有些可成為疾病的直接原因。隨著人類基因組的最新發(fā)展及技術(shù)的出現(xiàn),也為復(fù)雜特性的研究提供了新的工具,其中單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)是人群遺傳多態(tài)性的主要表達(dá)形式之一。

    單核苷酸多態(tài)性(SNP)是人基因組內(nèi)最廣泛的遺傳變異,它也是體現(xiàn)人群中個(gè)體差異的DNA序列變化中最基本和最常見的形式。SNP是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異而引起的DNA序列多態(tài)性,即基因組內(nèi)特定核苷酸位置上存在兩種不同的堿基,其中一種在群體中的頻率不小于1%,包括單個(gè)堿基的轉(zhuǎn)換、顛換、插入或缺失,其在臨床醫(yī)學(xué)上主要應(yīng)用于疾病的易感基因定位、器官的移植及藥物基因組學(xué)等方面。人類絕大多數(shù)遺傳變異是由SNP所致[7]。由于SNP分布廣,數(shù)量多,遺傳特性穩(wěn)定,易于批量自動(dòng)化檢測(cè)。所以,SNP己經(jīng)成為第3代遺傳標(biāo)記,廣泛應(yīng)用與多基因疾病如人類腫瘤、自身免疫性疾病等相關(guān)基因的研究。多種遺傳基因與人類SLE相關(guān),因此尋求SLE相關(guān)基因成為目前的一個(gè)研究熱點(diǎn)。目前己知基因有免疫球蛋白Fc受體ⅡA、ⅡB、ⅢA和ⅢB,細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞相關(guān)抗原4,胰脫氧核糖核酸酶Ⅰ,程序性細(xì)胞死亡1,單核細(xì)胞趨化蛋白1,酪氨酸激酶-,Toll-樣受體9,干擾素調(diào)節(jié)因子5,蛋白酪氨酸磷酸酶22,血管緊張素轉(zhuǎn)化酶,甘露糖結(jié)合凝集素,骨橋蛋白(osteopontin,OPN)等[8-20],通過(guò)基于基因組DNA序列變異的遺傳學(xué)分析,有望為人類揭開復(fù)雜性狀多基因疾病的分子機(jī)制。

    近年來(lái),白細(xì)胞介素10(interlenkin-10,IL-10)受到廣泛關(guān)注,被認(rèn)為是體內(nèi)最重要的抑炎細(xì)胞因子,對(duì)炎性反應(yīng)的調(diào)控起非常重要的作用。IL-10最初是由美國(guó)DNAX研究所Fiorentino在1989年發(fā)現(xiàn)鼠輔助性T細(xì)胞Th2亞型細(xì)胞分泌的一種細(xì)胞因子,能抑制Th1細(xì)胞株細(xì)胞因子RNA的轉(zhuǎn)錄,所以最初被稱為細(xì)胞因子合成抑制因子(cytokinesynthesis inhibitory factor,CSIF),同年命名為IL-10。人IL-10含178個(gè)氨基酸殘基,內(nèi)有18氨基酸信號(hào)序列,相對(duì)分子質(zhì)量為18.7×103。人IL-10基因定位于第1號(hào)染色體q31~32,其基因組包括5個(gè)外顯子和4個(gè)內(nèi)含子。在轉(zhuǎn)錄起始部位上游-1082(G/A)、-819(C/T)、-592(C/A)處有3個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn),2個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)(IL-l0G和IL-10R,位于上游1.2kb和4kb處)[13,14]。研究表明,啟動(dòng)子多態(tài)性與IL-10表達(dá)水平有密切聯(lián)系,-1082G、-819C、-592C相對(duì)于-1082A、-819T、-592A為高表達(dá)等位基因[15]。本文擬對(duì)SLE患者IL-10基因啟動(dòng)子區(qū)域-592A/C位點(diǎn)的多態(tài)性研究,以探討SLE的發(fā)病機(jī)制。

    1 材料與方法

    1.1 研究對(duì)象

    1.1.1 SLE患者組

    選取2008年11月至2009年06月期間SLE確診患者145例,年齡13~73歲,平均年齡34歲,男女比例為18∶127。所有SLE患者均符合1997的美國(guó)風(fēng)濕病學(xué)會(huì)診斷和治療標(biāo)準(zhǔn)委員會(huì)所制定的分類標(biāo)準(zhǔn)。

    1.1.2 健康對(duì)照組

    收集健康體檢者80例,年齡21~70歲,平均年齡39歲,男女比例為9∶71。經(jīng)詢問(wèn)病史、體格檢查和常規(guī)生化化驗(yàn)、心電圖及胸片等輔助檢查,確認(rèn)無(wú)器質(zhì)性疾病,且既往無(wú)風(fēng)濕病及其他自身免疫性疾病,近期無(wú)感染性疾病。

    1.2 試劑與儀器

    1.2.1 主要試劑

    全血基因組DNA快速提取試劑盒(北京百泰克生物技術(shù)有限公司);Taq DNA Polymerase(TIANGEN BIOTECH);RsaI內(nèi)切酶(紐英倫生物技術(shù)(北京)有限公司);引物;dNTP等。

    1.2.2 主要儀器

    Eppendorf高速離心機(jī);基因擴(kuò)增儀;pharmacia biotech電泳儀;電泳槽;Epson掃描儀等。

    1.3 方法

    1.3.1 DNA的提取

    按試劑說(shuō)明書進(jìn)行提取。

    1.3.2 PCR擴(kuò)增

    94℃反應(yīng)5min,94℃反應(yīng)35s→ 56℃反應(yīng)40s→ 72℃反應(yīng)50s→循環(huán)反應(yīng)上述步驟34次。1.3.3 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)

    1.3.3.1 聚丙烯酰胺凝膠電泳

    1.3.3.2 染色

    ①電泳結(jié)束后取出凝膠,放置到染色盤中。②加入0.3%的硝酸銀蓋過(guò)膠,放到搖床上染色反應(yīng)15min后用蒸餾水洗3次。③加2%NaON至蓋過(guò)膠,放到搖床上反應(yīng)15min,此時(shí)可以看到凝膠上顯示出清晰的條帶。④加少量冰醋酸終止顯色。

    1.3.3.3 采圖

    用掃描儀采圖并保存。

    1.3.4 擴(kuò)增產(chǎn)物的限制性酶切

    ①酶切體系配制(10μL):水:7.8μL;10×NEB緩沖液:1μL;內(nèi)切酶:0.2μL;PCR產(chǎn)物:1μL。②酶切:把配制好的擴(kuò)增管放入37℃孵育6h。

    1.3.5 酶切產(chǎn)物檢測(cè)

    方法同PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)。

    1.3.6 結(jié)果判讀

    綜上所述,企業(yè)內(nèi)部控制的發(fā)展對(duì)是企業(yè)財(cái)務(wù)勝仗的保障兵,科學(xué)化提高電算化的管理水平更是是重中之重在建立現(xiàn)代化企業(yè)制度的同時(shí),更能夠提高企業(yè)產(chǎn)品的競(jìng)爭(zhēng)能力。同時(shí),要充分考慮我國(guó)內(nèi)外經(jīng)濟(jì)環(huán)境與企業(yè)實(shí)際情況,靈活把握管控的方式方法,力求摸索出一套完善靈活的成本管理和內(nèi)控體系模式。

    ①PCR產(chǎn)物電泳出現(xiàn)一條412bp的條帶。②酶切產(chǎn)物電泳出現(xiàn)三種情況:RsaⅠ內(nèi)切酶不能切割C等位基因,而A等位基因可以被切割成236bp和176bp兩個(gè)片段。

    AA:電泳呈現(xiàn)兩個(gè)條帶——236bp和176bp;CC:電泳呈現(xiàn)一個(gè)條帶——412bp;AC:電泳呈現(xiàn)三個(gè)條帶——412bp,176bp和236bp。

    1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理

    1.4.1 數(shù)據(jù)處理方法

    ①用直接計(jì)數(shù)法計(jì)算基因頻率。②以χ2檢驗(yàn)進(jìn)行兩組間基因頻率的顯著性檢驗(yàn)。P<0.05認(rèn)為有差異有顯著性。統(tǒng)計(jì)軟件:SPSS16.0。

    1.4.2 Hardy-Weinberg平衡定律

    計(jì)算各人群中的各等位基因頻率,采用Hardy-Weinberg平衡定律,判斷對(duì)照組和試驗(yàn)組等位基因是否已經(jīng)達(dá)到遺傳平衡,具有群體代表性才可以進(jìn)一步進(jìn)行兩組間的卡方檢驗(yàn)。

    2 結(jié) 果

    2.1 Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)結(jié)果

    SLE患者組及健康對(duì)照組Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)結(jié)果見表1。

    表1 基因型分布的Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)

    P>0.05,不能證明觀測(cè)值和期望值兩組數(shù)據(jù)有明顯差異,所以,符合Hardy-Weinberg平衡定律,樣本具有群體代表性。

    2.2 PCR結(jié)果

    PCR完成后,健康對(duì)照組產(chǎn)物電泳于400~500bp之間得到一條清晰的條帶,SLE試驗(yàn)組于400~500bp之間得到一條清晰的條帶,空白對(duì)照全程未查見條帶。結(jié)果如圖1所示。

    注:1-3為SLE患者組,4-5為空白對(duì)照,6、8為健康對(duì)照組,7為marker;a為600bp,b為500bp,c為400bp d為300bp;A、B、C、D為412bp

    注:1~4為SLE患者組結(jié)果,5-8為健康對(duì)照組結(jié)果,9-10為空白對(duì)照,11為marker;a為600bp,b為500bp,c為400bp,d為300bp,e為200bp;A為412bp,B為236bp,C為176bp;1、2、6、8為AA基因型,3、5為AC基因型,4、7為CC基因型

    2.3 酶切結(jié)果

    酶切完成后,電泳得到三種不同的圖像結(jié)果,籍此可以分為3種基因型,即AA、CC和AC。3種不同的基因型電泳圖如圖2所示。

    2.4 基因型分布結(jié)果

    根據(jù)酶切結(jié)果電泳圖,基因型分布結(jié)果見表2。

    表2 基因型分布結(jié)果

    IL-10基因-592C/A位點(diǎn)的基因型分布(AA/AC/CC)在SLE患者組(46.9%,38.6%,14.5%)和健康對(duì)照組(37.5%,47.5%,15.0%)中差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。

    2.5 基因頻率分布結(jié)果

    表3 基因頻率分布結(jié)果

    等位基因頻率在SLE患者組(A66.21%,C33.79%)和健康對(duì)照組(A61.25%,C38.75%)中差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。

    3 討 論

    動(dòng)物實(shí)驗(yàn)研究發(fā)現(xiàn),在lpr小鼠,由于Fas基因突變,細(xì)胞凋亡受到抑制,一些自身反應(yīng)性細(xì)胞保留下來(lái),可以促進(jìn)自身抗體的產(chǎn)生,此即所謂狼瘡素質(zhì)。具有這種素質(zhì)的個(gè)體,對(duì)狼瘡易感,結(jié)合體外環(huán)境的誘發(fā)因素,在細(xì)胞因子的調(diào)節(jié)作用下,多克隆B細(xì)胞活化,形成一種狼瘡環(huán)境并逐漸發(fā)展,引起機(jī)體一系列的免疫調(diào)節(jié)紊亂,表現(xiàn)為疾病狀態(tài)。在此狼瘡環(huán)境形成的過(guò)程中,細(xì)胞因子扮演著舉足輕重的角色,尤以IL-10為著。人們發(fā)現(xiàn)體內(nèi)IL-10水平的不同會(huì)導(dǎo)致個(gè)體對(duì)某些疾病的易感性、發(fā)病年齡及疾病嚴(yán)重程度的不同。孿生胎家系研究表明,IL-10的分泌水平75%是由遺傳決定的,而且主要受轉(zhuǎn)錄水平的控制。單核苷酸多態(tài)性是最常見的DNA序列多態(tài)性,21世紀(jì)初以來(lái),人們對(duì)一單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)進(jìn)行了廣泛研究。在整個(gè)IL-10基因上,從5’非翻譯區(qū)的啟動(dòng)子序列到3’非翻譯區(qū)存在著大量的SNP位點(diǎn)。其中啟動(dòng)子區(qū)域-108、-819、-592位置的SNP是研究的熱點(diǎn)。啟動(dòng)子負(fù)責(zé)與調(diào)節(jié)基因表達(dá)調(diào)控的因子相結(jié)合,其堿基的改變會(huì)直接影響基因的轉(zhuǎn)錄和表達(dá)。

    近年來(lái),人們對(duì)不同的SNP或單體型與疾病的易感性和嚴(yán)重性之間的聯(lián)系進(jìn)行了廣泛研究。Eskdale等[21]研究發(fā)現(xiàn),高加索人群中IL-10的基因多態(tài)性與SLE相關(guān)。Gibson等[22]也發(fā)現(xiàn)非裔美國(guó)人群中IL-10啟動(dòng)子區(qū)的單核苷酸多態(tài)性與SLE相關(guān)。Chen等[23]通過(guò)檢測(cè)IL-10基因啟動(dòng)子區(qū)域3個(gè)SNPs-1082、-819、-592的基因型和單倍型發(fā)現(xiàn):3個(gè)SNPs的單倍型在SLE患者和正常人中差異有顯著性。王美美等[24]研究發(fā)現(xiàn),SLE患者外周血單個(gè)核細(xì)胞分泌Th2型細(xì)胞因子IL-10的水平較正常人增高,且增高程度與SLE病情活動(dòng)性相關(guān)。黎莉等[25]對(duì)未經(jīng)藥物治療的初發(fā)SLE患者和正常人的IL–10 mRNA及其受體表達(dá)的研究發(fā)現(xiàn),初發(fā)SLE患者IL-10mRNA與正常人無(wú)明顯差異,但I(xiàn)L-10R表達(dá)明顯升高。Shen等[23]研究發(fā)現(xiàn):中國(guó)SLE患者中IL-10G138bp等位基因頻率較正常人群有顯著差異,對(duì)單一位點(diǎn)運(yùn)用傳遞不平衡檢驗(yàn)分析證實(shí)IL-10G138bp等位基因優(yōu)先傳遞給受累子代。上述結(jié)果均提示IL-10基因是SLE重要的易感基因。

    本文就IL-10基因-592C/A多態(tài)性與SLE易感性之間的關(guān)系展開研究,選取145例SLE患者和80例健康對(duì)照者的全血標(biāo)本,提取基因組DNA,采用SNP的方法,分析基因型,用卡方檢驗(yàn)的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法檢驗(yàn)得出SLE試驗(yàn)組(AA 46.9%:AC 38.6%:CC 14.5%)和對(duì)照組(AA 37.5%:AC 47.5%:CC 15.0%)基因型無(wú)顯著性差異(P>0.05),基因頻率試驗(yàn)組(A 66.21%:C 33.79%)和對(duì)照組(A 61.25%:C 38.75%)也無(wú)顯著性差異(P>0.05)。本研究結(jié)果顯示,IL-10-592C/A的多態(tài)性在SLE患者與健康對(duì)照者之間尚未發(fā)現(xiàn)顯著性差異,表明IL-10-592C/A的多態(tài)性與SLE易感性可能無(wú)關(guān),但它們與其他多個(gè)基因位點(diǎn)的連鎖可能是導(dǎo)致SLE發(fā)病的原始基因缺陷之一。因此,IL-10與其他多個(gè)基因位點(diǎn)的連鎖是進(jìn)一步研究關(guān)注的重點(diǎn)。

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    The Research of Genetic Association of Interleukin-10 Polymorphisms with Systemic Lupus Erythematosus

    REN Xiao-ying1, LI Yan2, REN Li-lin3, WANG Li4, WU Yong-kang2*
    (1 Department of Laboratory, Chengdu First People's Hospital, Chengdu 610041, China;
    2 Department of Experimental Medicine, Huaxi Hospital of Sichuan University, Chengdu 610041, China;
    3 Geriatrics Hospital of Chengdu, Chengdu 610041, China;
    4 Department of Gynecology and Obstetrics, 452 Hospital of PLA, Chengdu 610041, China)

    ObjectiveTo investigate the relationship between the polymorphism of IL-10 gene-592C/A and susceptivity of SLE.MethodsThe whole blood specimens of 145 SLE patients and 80 healthy control subjects were collected. All samples were extracted genomic DNA, got the distribution of IL-10 gene-592C/A polymorphism by using PCR, digested by restriction enzyme and electrophoresised.ResultsNo signifi cantly difference was found in IL-10 gene-592 C/A polymorphism between SLE patients and healthy controls (P>0.05).ConclusionIL-10 gene-592 C/A polymorphism have no association with susceptibility of SLE.

    IL-10; Gene polymorphism; SNP; Systemic lupus erythematosus

    R593.24

    B

    1671-8194(2011)04-0024-03

    *通訊作者:E-mail: vipwyk@163.com

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