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      建立中文循證醫(yī)學(xué)證據(jù)知識(shí)庫探要*——以佳木斯大學(xué)圖書館為例

      2010-03-22 07:53:39孫海英
      圖書館學(xué)刊 2010年1期
      關(guān)鍵詞:知識(shí)庫循證證據(jù)

      孫海英

      (佳木斯大學(xué)圖書館,黑龍江 佳木斯 154007)

      循證醫(yī)學(xué)(evidence-based medicine,EBM)是20世紀(jì)末產(chǎn)生的臨床醫(yī)學(xué)新興交叉學(xué)科,一經(jīng)問世,在國際、國內(nèi)臨床醫(yī)學(xué)領(lǐng)域內(nèi)得到了迅速發(fā)展。其核心思想是:任何醫(yī)療決策都應(yīng)建立在新近最佳臨床研究證據(jù)(current best evidence)的基礎(chǔ)上,即遵循證據(jù)的臨床醫(yī)學(xué)。目的是為了臨床醫(yī)療決策的科學(xué)化。進(jìn)入網(wǎng)絡(luò)時(shí)代,信息和證據(jù)的檢索日趨完善,計(jì)算機(jī)和決策支持以及臨床實(shí)踐指南不斷更新,使臨床證據(jù)的獲得更為快速和便捷。但是我國與發(fā)達(dá)國家比較還有很大差距,在傳統(tǒng)經(jīng)驗(yàn)醫(yī)學(xué)向循證醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)變過程中,還需要下大力氣向廣大臨床醫(yī)學(xué)工作者普及循證醫(yī)學(xué)理論和方法,指導(dǎo)循證醫(yī)學(xué)臨床研究與實(shí)踐。因此建立中文循證醫(yī)學(xué)證據(jù)知識(shí)庫對(duì)于循證醫(yī)學(xué)的普及和發(fā)展具有重要作用。

      1 循證醫(yī)學(xué)及其知識(shí)庫發(fā)展現(xiàn)狀

      1.1 知識(shí)庫及其特點(diǎn)

      知識(shí)庫又稱智能數(shù)據(jù)庫或人工智能數(shù)據(jù)庫,正是由于人工智能(AI)與數(shù)據(jù)庫(DB)這兩項(xiàng)計(jì)算機(jī)技術(shù)相結(jié)合才促使知識(shí)庫及其系統(tǒng)的產(chǎn)生和發(fā)展。作為一種開發(fā)工具與環(huán)境,知識(shí)庫為用戶開發(fā)基于知識(shí)的系統(tǒng)提供支撐。知識(shí)庫系統(tǒng)的核心組成部分是知識(shí)庫和推理機(jī)構(gòu)。知識(shí)庫是以一致的形式存貯知識(shí)的機(jī)構(gòu),推理機(jī)構(gòu)則是為了使用知識(shí)庫藏內(nèi)的知識(shí)執(zhí)行推理的控制機(jī)構(gòu)。

      知識(shí)庫系統(tǒng)具有下列特點(diǎn):

      ①具有支持?jǐn)?shù)據(jù)庫的全部功能,包括對(duì)大批量數(shù)據(jù)的高效存取以及數(shù)據(jù)共享、數(shù)據(jù)的安全性、并發(fā)控制、故障恢復(fù)等功能。

      ②具有存取知識(shí)、管理知識(shí)的功能。

      ③知識(shí)庫系統(tǒng)的核心部分是一個(gè)推理機(jī)構(gòu),它完成對(duì)知識(shí)的處理。

      ④一般以關(guān)系數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)為基礎(chǔ),外加一個(gè)規(guī)則庫與推理層,組成一個(gè)知識(shí)庫系統(tǒng)。

      ⑤一個(gè)知識(shí)庫系統(tǒng)一般應(yīng)能存儲(chǔ)與管理適量的事實(shí)與規(guī)則。

      1.2 循證醫(yī)學(xué)及其證據(jù)知識(shí)庫的發(fā)展現(xiàn)狀

      循證醫(yī)學(xué)(EBM)的產(chǎn)生與隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)(RCT)的問世和方法學(xué)發(fā)展密切相關(guān)。網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的發(fā)展起著巨大推動(dòng)作用。1948年英國醫(yī)學(xué)研究委員會(huì)領(lǐng)導(dǎo)開展了世界第一個(gè)臨床隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn),1976年美國心理學(xué)家Glass首次提出Mata-分析(Mata-analysis)一詞及其統(tǒng)計(jì)學(xué)分析方法。1982年,英國Chalmers提出了累積性Mata-分析概念,從而為完成針對(duì)某一干預(yù)措施所有高質(zhì)量RCT的系統(tǒng)評(píng)價(jià)提供了方法學(xué)支持,為循證醫(yī)學(xué)的產(chǎn)生提供了最好的證據(jù)。20世紀(jì)70年代,英國醫(yī)師Archie Cochrane及其同事率先進(jìn)行了探索性研究,其成果RCT和系統(tǒng)評(píng)價(jià)的真正里程碑,1992年加拿大Mcmaster大學(xué)循證醫(yī)學(xué)工作組正式在JAMA上發(fā)表文章,首次提出循證醫(yī)學(xué)的概念和術(shù)語。加拿大Mcmaster大學(xué)Sackett領(lǐng)導(dǎo)的課題小組將循證醫(yī)學(xué)(EBM)定義為“慎重、準(zhǔn)確和明智地應(yīng)用當(dāng)前所獲得的最好的研究證據(jù),同時(shí)結(jié)合臨床醫(yī)生的個(gè)人專業(yè)技能和多年臨床經(jīng)驗(yàn),考慮病人的價(jià)值和愿望,將三者完善地結(jié)合制定出病人的治療措施”。循證醫(yī)學(xué)與傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)的最大區(qū)別在于前者將醫(yī)學(xué)研究證據(jù)放在了臨床決策的首要位置,這就使得實(shí)踐EBM要解決的核心問題是:如何在浩如煙海的信息、文獻(xiàn)中篩選出最恰當(dāng)和最優(yōu)的證據(jù)。

      網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的發(fā)展推動(dòng)著醫(yī)學(xué)領(lǐng)域信息資源的數(shù)字化,1976年美國斯坦福大學(xué)的醫(yī)學(xué)專家系統(tǒng)MYCIN被認(rèn)為是醫(yī)療專家系統(tǒng)最成功的實(shí)例之一。MYCIN的成功研制,激發(fā)和鼓舞了把專家系統(tǒng)技術(shù)應(yīng)用于醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的努力,特別是對(duì)醫(yī)學(xué)專家系統(tǒng)的核心部分——醫(yī)學(xué)知識(shí)庫的廣泛研究已經(jīng)成為人工智能研究中最活躍的一個(gè)分支,推動(dòng)了循證醫(yī)學(xué)的迅速興起和發(fā)展。

      1993年底,英國Iain Chamers博士創(chuàng)建Cochrane協(xié)作網(wǎng),隨后由Sackett領(lǐng)導(dǎo)Cochrane協(xié)作網(wǎng)生產(chǎn)Cochrane系統(tǒng)評(píng)價(jià),建立臨床研究數(shù)據(jù)庫的工作,標(biāo)志循證醫(yī)學(xué)證據(jù)獲取走上了人工智能化道路。

      隨著信息高速公路和循證醫(yī)學(xué)的迅速發(fā)展,數(shù)字化的信息資源成為查找醫(yī)學(xué)證據(jù)的主要來源,EBM信息資源日趨豐富。目前,按不同的標(biāo)準(zhǔn)可對(duì)網(wǎng)上EBM信息資源進(jìn)行不同的分類,有人按其內(nèi)容分為:系統(tǒng)評(píng)價(jià)、臨床實(shí)踐指南、衛(wèi)生技術(shù)評(píng)估、臨床試驗(yàn);也有人按其類型分為:EBM電子期刊、網(wǎng)上循證醫(yī)學(xué)資源中心、EBM醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫、EBM元搜索引擎、臨床實(shí)踐指南等等。雖然目前EBM信息資源種類和數(shù)量日趨增多,但都處于一種分散的狀態(tài),不便于醫(yī)學(xué)工作者的集中使用,這也正是建立中文循證醫(yī)學(xué)證據(jù)知識(shí)庫的原因之一。

      2 建立中文循證醫(yī)學(xué)知識(shí)庫的意義

      2.1 為數(shù)字圖書館建設(shè)增加高質(zhì)量的館藏

      佳木斯大學(xué)圖書館作為黑龍江省東部地區(qū)規(guī)模最大、設(shè)備最優(yōu)、現(xiàn)代化水平最高的高校圖書館,在數(shù)字化圖書館建設(shè)中已經(jīng)建立了自己的特色化道路,建設(shè)了一系列特色數(shù)據(jù)庫,中文循證醫(yī)學(xué)證據(jù)知識(shí)庫的建立,無疑將成為數(shù)字圖書館館藏的重要組成部分。與圖書館機(jī)構(gòu)知識(shí)庫一起,構(gòu)成圖書館知識(shí)庫體系。

      2.2 為臨床醫(yī)學(xué)院師生提供知識(shí)服務(wù)

      知識(shí)服務(wù)是指向用戶提供經(jīng)過智能化處理的符合用戶需求的知識(shí)產(chǎn)品。中文循證醫(yī)學(xué)證據(jù)知識(shí)庫所提供的循證醫(yī)學(xué)知識(shí)信息、知識(shí)手段及問題解決方案,是以解決用戶問題方案為直接目標(biāo)的,是面對(duì)本校臨床醫(yī)學(xué)院師生的。中文循證醫(yī)學(xué)證據(jù)知識(shí)庫不僅為循證醫(yī)學(xué)教學(xué)提供比較全面、系統(tǒng)的循證醫(yī)學(xué)知識(shí),而且為學(xué)生臨床實(shí)習(xí)和教師指導(dǎo)實(shí)習(xí)提供科學(xué)的臨床證據(jù),促進(jìn)師生實(shí)現(xiàn)最佳教學(xué)效果和臨床實(shí)踐成果。

      2.3 為臨床醫(yī)生提供科學(xué)的臨床證據(jù)

      佳大三所附屬醫(yī)院的臨床醫(yī)生以及黑龍江省東部地區(qū)醫(yī)院的醫(yī)生都可以通過網(wǎng)絡(luò)或光盤的形式享受循證醫(yī)學(xué)證據(jù)知識(shí)庫的知識(shí)服務(wù),從而為普及循證醫(yī)學(xué)和推動(dòng)循證醫(yī)學(xué)發(fā)展做出貢獻(xiàn)。

      3 中文循證醫(yī)學(xué)證據(jù)知識(shí)庫的架構(gòu)

      3.1 知識(shí)架構(gòu)

      循證醫(yī)學(xué)是運(yùn)用流行病學(xué)的科學(xué)方法論解決醫(yī)學(xué)各種問題而發(fā)生的一場(chǎng)醫(yī)學(xué)實(shí)踐的革命。循證醫(yī)學(xué)則認(rèn)為:經(jīng)驗(yàn)遠(yuǎn)不如科學(xué)研究的知識(shí)快速和可靠,從科研中學(xué)習(xí)是第一位的,經(jīng)驗(yàn)僅可以彌補(bǔ)科研知識(shí)的不足。循證醫(yī)學(xué)依賴于計(jì)算機(jī)、網(wǎng)絡(luò)通訊、互聯(lián)網(wǎng)等技術(shù),而循證醫(yī)學(xué)臨床證據(jù)知識(shí)庫則是其核心。關(guān)鍵是臨床研究證據(jù)質(zhì)量及其知識(shí)體系。

      循證醫(yī)學(xué)知識(shí)庫的知識(shí)體系可分為3個(gè)層面:

      第一層面:循證醫(yī)學(xué)知識(shí)的主要方面(一級(jí)架構(gòu))包括:“基礎(chǔ)”知識(shí)、循證方法、實(shí)用知識(shí)、支持體系和其他知識(shí)。

      第二層面:循證醫(yī)學(xué)基本知識(shí)的架構(gòu)(循證方法、二級(jí)架構(gòu))包含循證實(shí)踐操作流程和各步驟的展開。構(gòu)成循證醫(yī)學(xué)的基本知識(shí)和核心知識(shí)——循證方法。

      第三層面:循證醫(yī)學(xué)實(shí)用知識(shí)的架構(gòu)(三級(jí)架構(gòu))是循證流程與病癥的描述和處理流程的融合。包括病癥表現(xiàn)的循證、流行情況的循證、病因的循證、危險(xiǎn)因素的循證、診斷的循證、治療的循證、預(yù)防的循證和預(yù)后的循證等。

      3.2 內(nèi)容的分類

      為有利于對(duì)知識(shí)庫使用者提供準(zhǔn)確快捷的臨床研究證據(jù),知識(shí)庫的證據(jù)可以根據(jù)不同需要分類:

      3.2.1 按研究方法分類。①原始研究證據(jù)(primary research evidence);②二次研究證據(jù)(secondary research evidence)。

      3.2.2 按研究問題分類。①病因臨床研究證據(jù);②診斷臨床研究證據(jù);③預(yù)防臨床研究證據(jù);④治療臨床研究證據(jù);⑤預(yù)后臨床研究證據(jù)。

      3.2.3 按用戶需要分類。①系統(tǒng)評(píng)價(jià);②臨床實(shí)踐指南;③臨床決策分析;④臨床證據(jù)手冊(cè);⑤衛(wèi)生技術(shù)評(píng)估;⑥健康教育資料。

      3.2.4 按獲取渠道分類:①公開發(fā)表的臨床研究證據(jù);②網(wǎng)上信息;③已完成,但未公開發(fā)表的臨床研究證據(jù);④在研的臨床研究信息。

      3.3 研究證據(jù)的來源

      由于中文循證醫(yī)學(xué)證據(jù)知識(shí)庫都是中文臨床研究證據(jù)信息,因此知識(shí)庫臨床研究證據(jù)的來源也必然都是中文數(shù)據(jù)庫、網(wǎng)絡(luò)、雜志、會(huì)議文獻(xiàn)以及在研和未發(fā)表的臨床試驗(yàn)等。

      目前,數(shù)據(jù)庫資源中書目數(shù)據(jù)庫有“中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫”、“中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫”。臨床研究證據(jù)專用數(shù)據(jù)庫有中文循證醫(yī)學(xué)圖書館(中文光盤版),由中國循證醫(yī)學(xué)/(cochrane)中心和當(dāng)?shù)剀浖竟餐_發(fā)制作。收錄了系統(tǒng)評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)庫、臨床對(duì)照試驗(yàn)數(shù)據(jù)庫、循證醫(yī)學(xué)方法數(shù)據(jù)庫、衛(wèi)生技術(shù)評(píng)估數(shù)據(jù)庫等循證醫(yī)學(xué)一些相關(guān)知識(shí)與信息等數(shù)據(jù)庫信息。網(wǎng)站有中國衛(wèi)生部、中國疾病預(yù)防控制中心、中華醫(yī)學(xué)會(huì)網(wǎng)站、中國循證醫(yī)學(xué)中心網(wǎng)站等網(wǎng)站。此外有《中國循證醫(yī)學(xué)雜志》、《循證醫(yī)學(xué)》等醫(yī)學(xué)雜志,還可以從國家科技圖書文獻(xiàn)中心、中國醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文數(shù)據(jù)庫等獲取會(huì)議文獻(xiàn)信息。

      4 相關(guān)的技術(shù)問題

      4.1 研究證據(jù)的采集

      研究證據(jù)的采集從兩方面獲取。一是由雜志、會(huì)議文獻(xiàn)等紙質(zhì)臨床研究證據(jù)經(jīng)過掃描、識(shí)別、標(biāo)引、引入證據(jù)知識(shí)庫,完成采集工作;二是直接從網(wǎng)絡(luò)現(xiàn)有的數(shù)據(jù)庫中檢索出自己所需要的臨床研究證據(jù),經(jīng)過工具軟件轉(zhuǎn)換后進(jìn)行標(biāo)引,引入證據(jù)知識(shí)庫。

      4.1.1 雜志文集采集流程。①書頁掃描,即利用掃描儀對(duì)所需文獻(xiàn)進(jìn)行掃描;②圖像處理,是指傾斜校正、去噪、剪裁、粘貼、亮度對(duì)比度調(diào)整、除裝訂線、內(nèi)容居中等處理,目的是為了提高OCR識(shí)別率及美觀整齊度;然后把一篇文章經(jīng)掃描處理后的書頁合并起來,存為PDF或TIF文件,生成與印本文獻(xiàn)對(duì)應(yīng)的數(shù)字對(duì)象文件。

      4.1.2 網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫的采集流程。①手工采集:可以采用搜索引擎技術(shù)實(shí)現(xiàn)對(duì)網(wǎng)絡(luò)中特色信息資源的采集。按照預(yù)先制定的檢索詞、檢索策略,利用通用搜索引擎如Google、Yahoo、Baidu等進(jìn)行檢索并不斷調(diào)整檢索策略,直到得出較為滿意的檢索結(jié)果,手動(dòng)將所需信息進(jìn)行下載、格式轉(zhuǎn)換、標(biāo)引、加入知識(shí)庫。②自動(dòng)采集:面對(duì)數(shù)量大、更新快的網(wǎng)絡(luò)信息資源,手工采集、組織信息的方法顯然不能勝任工作,通常的解決方法是利用計(jì)算機(jī)技術(shù)實(shí)現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)信息資源的自動(dòng)采集與組織。自動(dòng)采集軟件對(duì)網(wǎng)頁進(jìn)行精確分析后,將信息的標(biāo)題、來源、內(nèi)容、發(fā)布時(shí)間等項(xiàng)目存入知識(shí)庫。③具有訪問權(quán)限的網(wǎng)絡(luò)信息資源的采集:現(xiàn)有的數(shù)據(jù)庫,特別是使用價(jià)值較高的數(shù)據(jù)庫,大多提供網(wǎng)絡(luò)服務(wù)方式,采用密碼口令或IP地址控制的方法實(shí)現(xiàn)用戶對(duì)這些數(shù)據(jù)庫或其鏡像站的訪問。主要采用手工采集、轉(zhuǎn)換格式和標(biāo)引的方法。

      4.2 研究證據(jù)知識(shí)庫的發(fā)布

      4.2.1 Internet發(fā)布。WWW是一種建立在Internet上的全球性、多平臺(tái)、分布式、多媒體的動(dòng)態(tài)信息系統(tǒng)。同TELNET、GOPHER、FTP、WAIS等相似,它也是建立在Internet上的一種網(wǎng)絡(luò)服務(wù)。WWW是Internet上發(fā)展最快、應(yīng)用最廣泛也最實(shí)用的超文本信息發(fā)布系統(tǒng),它將復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)操作通過超文本技術(shù)和簡(jiǎn)單的協(xié)議變成了簡(jiǎn)單的“點(diǎn)擊”,用戶不需要網(wǎng)絡(luò)知識(shí)和約定便可以容易地訪問任意地點(diǎn)的計(jì)算機(jī)資源。為了滿足用戶使用的交互性,需要通過專門的手段將數(shù)據(jù)庫與WWW連接起來,這些手段主要有CGI技術(shù)、專用API技術(shù)、JAVA/JDBC技術(shù)等。通過這些手段建立起數(shù)據(jù)庫的WWW服務(wù)器,用戶通過Internet登錄到服務(wù)器上,執(zhí)行瀏覽、檢索等操作。通過Internet發(fā)布:一是用戶不需要專門設(shè)備,只需要一臺(tái)計(jì)算機(jī)、一根網(wǎng)線就可以使用數(shù)據(jù);二是實(shí)時(shí)數(shù)據(jù),服務(wù)器更新后,用戶不用升級(jí)直接可以得到最新信息。

      4.2.2 光盤發(fā)布。由于技術(shù)的發(fā)展,無論是服務(wù)器還是個(gè)人計(jì)算機(jī)都帶有光盤驅(qū)動(dòng)器,可以對(duì)光盤進(jìn)行讀取,這使得用光盤作為媒介發(fā)行臨床研究證據(jù)成為可能。一是存儲(chǔ)量大,一張VCD光盤的容量為700MB,而DVD則達(dá)到4.7GB;二是成本低,無論是VCD還是DVD,每張盤片的價(jià)格均不高;三是保存時(shí)間長(zhǎng),便于攜帶。我們所選用的知識(shí)庫建設(shè)平臺(tái)里都有信息發(fā)布系統(tǒng),我們可以通過知識(shí)庫建設(shè)平臺(tái)對(duì)所建的知識(shí)庫進(jìn)行發(fā)布,為用戶提供服務(wù)。

      [1] 李幼平.循證醫(yī)學(xué)[M].北京:高等教育出版社,2003.

      [2] 王吉耀.循證醫(yī)學(xué)與臨床實(shí)踐[M].北京:科技出版社,2006.

      [3] 李玨.循證醫(yī)學(xué)電子停息資源整合的探討[J].循證醫(yī)學(xué),2007(2).

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